1965年，阿日浑迪戈壁发生一起钻井事故，勘探员楚瀚文在灾难中离奇失踪，案件就此尘封。二十年后，冷湖油田突然收到来自地层深处的神秘信号，这起旧案被重新揭开。随着调查深入，一个惊人的真相浮出水面——戈壁之下存在着名为“混迪”的未知生命体，它能够寄生人体引发异变，并在感染者之间构建起庞大的共享意识网络。楚瀚文的儿子楚南飞带领团队深入戈壁深渊，他们不仅要面对异变感染者的威胁，还要与试图掌控这股力量的野心组织“自然科学会”周旋。在危机四伏的地下世界中，楚南飞一面追寻父亲失踪的真相，一面在亲情创伤与人性抉择中挣扎。而拥有自我意识的混迪，也在暗中观察、学习着人类的行为与情感。当人类试图压制或利用混迪的所有方案相继失败，双方终于意识到，对抗只会带来毁灭。在深渊尽头，人类与异类放下偏见与恐惧，共同探索一条属于双方的觉醒之路，开启一个全新的未来。
